台灣位居季風氣候影響圈，夏季濕熱季風帶來充沛降雨及強風，淡水與營養鹽大量注入沿岸，促進浮游植物與浮游生物繁盛；冬季東北季風則穩定水體分層，促成近海的營養循環，但過度濁水與上游泥沙也易傷害珊瑚礁與海草床。颱風季更使海面混合作用劇增，推動能量與碳循環，但同時侵蝕海岸、改變魚群棲地。理解季風對海洋生態的影響，對於海洋管理、漁業配額與珊瑚保育至關重要，需跨部門監測與因應氣候變遷策略。